The role of the microbiome in human and animal health is one of the most rapidly advancing areas within life sciences, with growing relevance for food and feed safety risk assessment. Microbiome-related considerations are already emerging in current safety assessments for example in the areas of pesticides, novel foods or food and feed additives, and regulatory applications directly involving complex microbial community products are expected in the near future. Despite these developments, the methodological tools, evidence standards and regulatory science frameworks needed to systematically incorporate microbiome data into the risk assessment remain scarse and difficult to implement. Existing guidance was not developed with microbiome endpoints in mind, and risk assessors currently lack the methods and data that would enable to address microbiome-related questions consistently and robustly.

EFSA and the broader regulatory science community have made significant investments in mapping these gaps and have collectively documented where the science is insufficient for regulatory purposes. The 2026 Scientific Colloquium on Microbiomes builds on this foundation, starting from the documented gaps and exploring what actions are needed to address them, in what order and by whom.

The colloquium addresses two domains where microbiome-related regulatory science challenges are most pressing within food and feed domains. The first is the assessment of chemicals such as pesticides, food and feed additives, and contaminants where the gut microbiome may both be a target of chemical-induced effects with consequences for host health and may also play a role in modulating chemical exposure through biotransformation. The second is the safety assessment of biological and microbiome-based products such as complex microbial feed additives and next-generation probiotic products, where the product itself intentionally aims to modulate the host microbiome and where current assessment frameworks may be insufficient. Both domains are addressed from a human and animal health perspective. The environmental microbiome such as soil, aquatic and other environmental microbial communities, is not addressed in this colloquium. EFSA intends to address environmental microbiome assessments in a subsequent dedicated initiative.

The colloquium is co-organised by EFSA and INRAE, with the French organisation also co-coordinating the World Microbiome Partnership, reflecting the importance of international collaboration in advancing microbiome regulatory science.

The overarching objective of the colloquium is to assess the maturity of available microbiome science relative to regulatory risk assessment needs, and to define what actions are required to bridge the gap between existing scientific knowledge and its use in food and feed safety risk assessments.

The colloquium is designed to produce three specific outputs:

• Output 1 — A structured maturity assessment for each domain addressed, distinguishing what is approaching sufficient regulatory science readiness, what requires further development and tailoring for risk assessment integration, and what requires longer-term research investment.
• Output 2 — A set of priority regulatory science actions, structured around three specific questions: what adversity criteria and evidence standards are needed before microbiome endpoints can be incorporated into regulatory decisions; what methods, data and reporting standards must be established for regulatory submissions involving microbiome data; and whether and how existing regulatory tools can be adapted to integrate microbiome-related endpoints.
• Output 3 — A gap-closing action plan identifying who does what and when, distinguishing what falls within EFSA's and partners' direct regulatory science remit, what requires international coordination, and what requires longer-term research investment that regulatory science organisations should advocate for.

Following the opening plenary session where introductory presentations will be shared, participants will break into four parallel discussion groups addressing specific domains:

Break-out Group 1 | Chemicals and the Microbiome — Human Health Risk Assessment

Break-out Group 2 | Chemicals and the Microbiome — Animal Health Risk Assessment

Break-out Group 3 | Biological and Microbiome Products — Human Health Risk Assessment

Break-out Group 4 | Biological and Microbiome Products — Animal Health Risk Assessment

The outcome of the discussion groups will be presented in a final plenary moderated panel discussion on Day 2, designed to formulate the conclusions of the event. EFSA will issue a short report collecting and summarising the discussions following the event which will be published together with the presentations shared at the event.

The event is intended for scientists, regulatory experts and other stakeholders with expertise at the interface of microbiome science and risk assessment Participation is limited to a maximum of 120 participants, including speakers and other experts already identified by EFSA and co-organisers. Given the colloquium's focus on producing actionable regulatory science outputs, participation is specifically sought from experts who combine scientific knowledge of microbiomes with experience or familiarity of risk assessment processes. Academic researchers with strong connections to regulatory science questions are also welcome. Representatives of national competent authorities, international organisations, research institutions and industry are all encouraged to apply. A selection process will ensure sufficient representation of relevant fields of expertise, stakeholder groups and geographical balance.

The registration form can be found at link

Please note that registration may close once the maximum number of participants is reached or, at the latest, by 14 September 2026 at 12.00 CEST. After closure of registration, applicants will be informed whether they have been selected for participation.

The event will be held in person in Brussels, Belgium on 23-24 November 2026 (Day 1: 09:00–18:00 CET; Day 2: 09:00–13:00 CET). English will be the language of the event, and no interpretation will be provided.

Online participation is not foreseen — please register for this event only if you are able to attend in person.

There is no fee for participation, however participants are responsible for covering their own expenses related to travel and accommodation. Further organisational details will be communicated to selected participants.

Do not hesitate to contact the organising committee at scientific.colloquia@efsa.europa.eu for more information.

Draft Programme

Öffentliche Veranstaltung mit der Möglichkeit, Fragen an die Experten*innen zu stellen

Plastik enthält Zusatzstoffe, die sich während der Nutzung aus Produkten wie beispielsweise Spielzeug, Funktionskleidung oder Lebensmittelverpackungen lösen können. Dadurch gelangen sie in die Umwelt und in den menschlichen Körper.

Erfahren Sie, was die aktuelle Wissenschaft zu Exposition und potenziellen Gefahren sagt und stellen Sie Ihre Fragen direkt an die Experten*innen:

• Dr. Jane Muncke, Food Packaging Forum
• Stephanie Eitner, Empa / ETH Zürich
• Dr. Elias Zimmermann, Empa

Der Eintritt ist frei. Es wird um eine Anmeldung gebeten. 

The Swiss Centre for Applied Human Toxicology (SCAHT) is organising a hands-on ToxMCP workshop on 6 November 2026 in Basel, led by Ivo Djidrovski (in4R.ai, Utrecht University).

Participants will learn how an AI assistant can connect to public toxicology sources through ToxMCP, and gather, organise and review evidence in a guided case study, while learning to recognise the limits of AI supported outputs and where expert judgement remains essential.

Date: 6 November 2026, 09:00–12:00

Format: In person, Kollegienhaus, Petersgraben 50, 4051 Basel

Lead: Ivo Djidrovski (in4R.ai, Utrecht University)

Audience: Toxicologists, risk assessors, regulatory scientists, computational scientists and students. No programming/AI experience required.

Capacity: Limited to 30 participants, advance registration required.

Participants will need their own laptop with admin rights, a desktop version of a large language model with an active paid subscription, and a free US EPA CTX API key ( to be requested in advance). A limited number of one month subscriptions might be available for students who cannot cover the cost themselves.

Registration link

Final Program (version from October 7th, 2026)

La validation est le plus grand obstacle pour que les New Approach Methodologies (NAM) deviennent de véritables outils dans l'évaluation des risques — ce n'est pas leur développement qui pose problème, mais la preuve qu'elles fonctionnent suffisamment bien pour être fiables et utilisées.

Le 20 octobre, le Swiss 3R Competence Center réunit à Berne des chercheurs, des représentants de l'industrie, des autorités de régulation et des décideurs politiques pour examiner directement ce parcours : des premiers fondements scientifiques jusqu'à l'acceptation réglementaire, à travers des études de cas concrètes de NAM à différents stades de validation.

Appel à projets de recherche en toxicologie humaine appliquée désormais ouvert

Les chercheurs intéressés peuvent soumettre leurs avant-projets jusqu’au 15 octobre 2026

Le Centre suisse de toxicologie humaine appliquée (SCAHT) a lancé aujourd’hui la préparation de son programme de recherche 2029-2032. Le SCAHT vise à mettre en place deux projets phares suisses en toxicologie réglementaire, démontrant comment les méthodologies de la nouvelle approche (NAM) pertinentes pour l’être humain, les biomarqueurs mécanistiques et la cinétique intégrée peuvent soutenir l’évaluation des risques de nouvelle génération (NGRA). À cette fin, les groupes de recherche suisses sont invités à élaborer des propositions pour deux projets de recherche collaboratifs intégrés et indépendants, axés sur l’évaluation des substances chimiques ayant des effets néfastes sur i) la santé reproductive féminine et ii) le système nerveux central. Pour chaque domaine, un projet sera financé.

i) La santé reproductive féminine englobe l’ensemble du cycle de vie reproductif de la femme, depuis le développement des cellules germinales jusqu’à une grossesse menée à terme, y compris le développement et le fonctionnement du placenta. Les propositions peuvent porter sur la toxicité des composés à n’importe quelle étape ou dans n’importe quel processus de ce cycle de vie.

ii) La neurotoxicité doit se concentrer sur le rôle des substances chimiques dans le développement des maladies neurodégénératives.

La pertinence pour la santé humaine doit être au cœur des deux thèmes.

Le financement accordé par la SCAHT pour les projets intégrés s’élève à 650 000 – 800 000 CHF par an, pour une durée de 4 ans par projet. En raison de la nature du financement de la SCAHT, les projets retenus devront être cofinancés par des contributions en nature (pour plus de détails, veuillez vous reporter au document d’appel à projets).

Chaque projet proposé doit être une initiative collaborative impliquant un chef de projet employé, au moins pendant la durée de la période de financement, par l’un des établissements d’enseignement supérieur actuellement membres de la SCAHT, à savoir l’Université de Bâle, l’Université de Genève, l’Université de Lausanne ou la FHNW School of Life Sciences, en collaboration avec plusieurs groupes de recherche issus d’institutions suisses. Les propositions doivent clairement démontrer en quoi la collaboration apporte une valeur ajoutée en combinant des expertises, des compétences techniques et des infrastructures complémentaires, générant ainsi des synergies scientifiques qui ne pourraient être obtenues par les groupes agissant isolément.

Les deux projets financés seront sélectionnés au terme d’un processus en deux étapes. Nous invitons les chercheurs à soumettre leurs avant-projets par e-mail à l’attention de Stéphanie Boudon (stephanie.boudon@scaht.org), en utilisant le formulaire de candidature, avant le 15 octobre 2026.

Des informations détaillées sur les conditions de participation ainsi que sur les procédures de soumission et de sélection sont disponibles dans le document d’appel à propositions.

Contacts SCAHT :

Questions concernant le programme de financement : Stéphanie Boudon, coordinatrice de la recherche et de la formation ; +41 61 207 19 59 ; stephanie.boudon@scaht.org

Lien vers le modèle de pré-proposition

Lien vers le document d’appel à propositions

L'EFSA a le plaisir de participer au programme de la troisième édition des « CRO Days » (Contract Research Organisation), organisés par l'Agence européenne des produits chimiques (ECHA). Cet événement réunira des experts en laboratoire et en réglementation afin d'échanger leurs points de vue sur les défis liés aux études toxicologiques, offrant ainsi aux CRO une occasion précieuse d'échanger avec les deux agences.

La réunion de cette année consacrée au plan d'action sur les produits phytosanitaires se tiendra le vendredi 4 septembre 2026 au Campus Liebefeld, Bern.

Nous vous prions de bien vouloir vous inscrire d'ici le 21 août via ce lien.

Participez à la réunion en ligne organisée par le BfR et l’université de Potsdam pour découvrir les analyses et les points de vue d’experts sur les raisons pour lesquelles la génotoxicité restera une priorité dans l’agenda réglementaire et sur les moyens nécessaires pour communiquer efficacement avec les consommateurs. Cet événement s’inscrit dans le cadre de la série d’événements en ligne « ILMERAC Expert Dialogue », qui vise à réunir des experts de premier plan du monde entier afin de favoriser l’échange de bonnes pratiques en matière d’évaluation réglementaire des risques.

Date limite d'inscription : 14 septembre 2026

Pour vous inscrire à cet événement, veuillez contacter l'équipe de l'ILMERAC à l'adresse ILMERAC@bfr.bund.de.

Nous avons le plaisir d’annoncer la 5e conférence de l’EFSA, qui marquera les 25 ans de l’EFSA et le lancement de la nouvelle stratégie 2034 (2028-2034). Cet événement réunira les acteurs du secteur de la sécurité alimentaire afin d’aborder des thèmes clés, notamment l’innovation et la compétitivité, la durabilité et l’approche « One Health », la préparation et la réaction rapide, la communication sur les risques et la numérisation.

Les inscriptions ouvriront en janvier 2027, et le compte à rebours officiel sera lancé sur le site web de l’EFSA en septembre 2026. De plus amples informations sur le programme et les modalités de participation seront communiquées en temps voulu.

L’EFSA et l’ECHA organiseront un atelier en présentiel afin de discuter de la mise en œuvre de la feuille de route de la Commission européenne visant à supprimer progressivement les essais sur les animaux dans le domaine des pesticides et des biocides. Les participants échangeront leurs points de vue sur les propositions et les approches permettant de faire progresser l’évaluation des risques dans ce domaine.

De plus amples informations sur le programme et les modalités d’inscription seront publiées en temps voulu via le lien ci-dessous.